Phòng Genomic

1. THÔNG TIN CHUNG

Địa chỉ: Phòng 241, Nhà T8, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, 334 Nguyễn Trãi, Thanh Xuân. 

Điện thoại: (+84)- 024-35575492

Thành viên chính thức hiện nay:

Trưởng phòng: PGS.TS. Trần Văn Tuấn

Điện thoại: 024-35575492 (office), 0906213318 (mobile)

Email: tuantran@vnu.edu.vn

Đào tạo: PhD: 2011, University of Göttingen, Germany

Postdoc: 2011-2013: Institute of Microbiology and Genetics, Göttingen, Germany

Chuyên ngành: Vi sinh vật học phân tử

TS. Thái Hạnh Dung

Điện thoại: 024-35575492 (office), 0915967619 (mobile)

Email: thaihanhdung@vnu.edu.vn

Đào tạo: PhD: 2023, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội

Chuyên ngành: Vi sinh vật học

Cựu thành viên:

PGS.TS. Võ Thị Thương Lan, ThS. Tạ Bích Thuận, ThS. Phạm Anh Thùy Dương, PGS.TS. Nguyễn Thị Hồng Vân, PGS.TS. Đỗ Thị Phúc, TS. Trần Đức Long, ThS. Trần Thị Thuỳ Anh

Hướng nghiên cứu chính:

  • Phát triển các hệ thống chuyển gen/biểu hiện gen/chỉnh sửa hệ gen tiên tiến phục vụ cải biến di truyền một số vi nấm công nghiệp, gồm Aspergillus oryzaeAspergillus niger, Aspergillus luchuensis, Penicillium rubens (Penicillium chrysogenum), Trichoderma harzianum, Cordyceps militaris nhằm tạo ra các chủng có năng suất cao về sinh tổng hợp enzyme, protein và các chất có hoạt tính sinh học.

  • Nghiên cứu phát triển công nghệ sản xuất mycoprotein từ sinh khối sợi nấm.

  • Nghiên cứu phát triển công nghệ mới để tạo chủng nấm dược liệu Cordyceps militaris an toàn, năng suất cao. Điều tra thành phần hoạt chất, khả năng kháng vi sinh vật, ức chế tế bào ung thư và điều hòa miễn dịch của những chủng nấm này.

  • Nghiên cứu ứng dụng vi sinh vật nội sinh (endophyte), vi sinh vật đối kháng và các chất có hoạt tính sinh học nhằm phát triển chế phẩm sinh học kiểm soát vi sinh vật gây hại trên cây trồng và nông sản sau thu hoạch.

Phát triển hệ thống chuyển gen nhờ vi khuẩn Agrobacterium tumefaciens
với hiệu suất cao phục vụ cải biến di truyền nấm sợi Aspergillus oryzae

    2. HOẠT ĐỘNG KHOA HỌC CÔNG NGHỆ

    Đề tài, dự án tiêu biểu:

    • Nghiên cứu phát triển hệ thống biểu hiện gen mới ở nấm dược liệu Cordyceps militaris phục vụ sản xuất enzym tái tổ hợp và các chất có hoạt tính sinh học (2020-2022). Đề tài cấp ĐHQGHN, mã số: KLEPT.20.03. Chủ trì: TS. Phạm Thị Thu Hường, thành viên nghiên cứu chủ chốt: PGS.TS. Trần Văn Tuấn.
    • Nghiên cứu phát triển công nghệ mới để lai tạo, phục hồi và duy trì các chủng nấm dược liệu Cordyceps militaris có hiệu suất cao về hình thành quả thể và sinh tổng hợp cordycepin (2020-2022). Đề tài cấp ĐHQGHN, mã số: QG.20.19. Chủ trì: PGS.TS. Trần Văn Tuấn.
    • Điều tra vai trò của các gen liên quan đến phức hệ protein velvet ở nấm sợi Aspergillus niger và Penicillium digitatum (2018-2021). Đề tài Quỹ NAFOSTED, mã số: 106.04-2018.36. Chủ trì: PGS.TS. Trần Văn Tuấn.
    • Phát triển và ứng dụng các vector nhị thể thế hệ mới phục vụ cải biến di truyền các loài nấm sợi thông qua phương pháp chuyển gen nhờ vi khuẩn Agrobacterium (2015-2018). Đề tài Quỹ NAFOSTED, mã số: 106-NN.04-2014.75. Chủ trì: PGS.TS. Trần Văn Tuấn.
    • Nghiên cứu thiết kế hệ thống vector biểu hiện gen nhằm nâng cao hiệu suất sinh tổng hợp enzyme ở nấm sợi Aspergillus oryzae (2014-2016). Đề tài cấp ĐHQGHN, mã số: KLEPT.14.01. Chủ trì: PGS.TS. Trần Văn Tuấn.

    Công trình khoa học tiêu biểu:

    1. Tao Xuan Vu, Tram Bao Tran, Hong-Ha Vu, Yen Thi Hoang Le, Phu Hung Nguyen, Thao Thi Do, Thu-Huong Nguyen, Van-Tuan Tran (2024). Ethanolic extract from fruiting bodies of Cordyceps militaris HL8 exhibits cytotoxic activities against cancer cells, skin pathogenic yeasts, and postharvest pathogen Penicillium digitatum. Archives of Microbiology 206(3):97.
    2. Van-Tuan Tran, Hanh-Dung Thai, Tao Xuan Vu, Ha Hong Vu, Giang Thu Nguyen, Minh Thi Trinh, Huyen Thi Thanh Tran, Huong Thi Thu Pham, Nhung Thi Hong Le (2023). An efficient Agrobacterium-mediated system based on the pyrG auxotrophic marker for recombinant expression in the filamentous fungus Penicillium rubens. Biotechnology Letters 45(5-6):689-702.
    3. Tao Xuan Vu, Tram Bao Tran, Minh Binh Tran, Trang Thi Kim Do, Linh Mai Do, Mui Thi Dinh, Hanh-Dung Thai, Duc-Ngoc Pham, Van-Tuan Tran (2023). Efficient control of the fungal pathogens Colletotrichum gloeosporioides and Penicillium digitatum infecting citrus fruits by native soilborne Bacillus velezensis strains. Heliyon 9(2):e13663.
    4. Hanh-Dung Thai, Loc Thi Binh Xuan Do, Xuan Thi Nguyen, Tao Xuan Vu, Huyen Thi Thanh Tran, Huy Quang Nguyen, Van-Tuan Tran (2023). A newly constructed Agrobacterium-mediated transformation system based on hisB auxotrophic marker for genetic manipulation in Aspergillus niger. Archives of Microbiology 205(5):183.
    5. Tao Xuan Vu, Hanh-Dung Thai, Bich-Hang Thi Dinh, Huong Thi Nguyen, Huyen Thi Phuong Tran, Khanh-Linh Thi Bui, Tram Bao Tran, Hien Thanh Pham, Linh Thi Dam Mai, Diep Hong Le, Huy Quang Nguyen, Van-Tuan Tran (2023). Effects of MAT1-2 spore ratios on fruiting body formation and degeneration in the heterothallic fungus Cordyceps militaris. Journal of Fungi 9:971.
    6. Wanping Chen, Xucong Lv, Van-Tuan Tran, Jun-ichi Maruyama, Kap-Hoop Han, Jae-Hyuk Yu (2022). From Traditional to Modern: Progress of Molds and Yeasts in Fermented-Food Production. Frontiers in Microbiology  13:876872.
    7. Hanh My Tran, Diep Hong Le, Van-Anh Thi Nguyen, Tao Xuan Vu, Nguyen Thi Kim Thanh, Do Hoang Giang, Nguyen Tien Dat, Hai The Pham, Marc Muller, Huy Quang Nguyen, Van-Tuan Tran (2022). Penicillium digitatum as a model fungus for detecting antifungal activity of botanicals: an evaluation on Vietnamese medicinal plant extracts. Journal of Fungi 8:956.
    8. Chu Thanh Binh, Hanh-Dung Thai, Bui Thi Viet Ha, Van-Tuan Tran (2021). Establishment of a new and efficient Agrobacterium-mediated transformation system in the nematicidal fungus Purpureocillium lilacinum. Microbiological Research 249:126773.
    9. Höfer AM, Harting R, Aßmann NF, Gerke J, Schmitt K, Starke J, Bayram Ö, Tran VT, Valerius O, Braus-Stromeyer SA, Braus GH (2021). The velvet protein Vel1 controls initial plant root colonization and conidia formation for xylem distribution in Verticillium wilt. PLoS Genetics 17(3):e1009434.
    10. Thai HD, Nguyen BT, Nguyen VM, Nguyen QH, Tran VT (2021). Development of a new Agrobacterium-mediated transformation system based on a dual auxotrophic approach in the filamentous fungus Aspergillus oryzae. World Journal of Micrbiology and Biotechnology 37:92.
    11. Vu TX, Vu HH, Nguyen GT, Vu HT, Mai LTD, Pham DN, Le DH, Nguyen HQ, Tran VT (2019). A newly constructed Agrobacterium-mediated transformation system revealed the influence of nitrogen sources on the function of the LaeA regulator in Penicillium chrysogenum. Fungal Biology 123(11):830-842.
    12. Bui TT, Harting R, Braus-Stromeyer SA, Tran VT, Leonard M, Höfer A, Abelmann A, Bakti F, Valerius O, Schlüter R, Stanley CE, Ambrósio A, Braus GH (2019). Verticillium dahliae transcription factors Som1 and Vta3 control microsclerotia formation and sequential steps of plant root penetration and colonisation to induce disease. New Phytologist 221(4):2138-2159.
    13. Vu TX, Ngo TT, Mai LTD, Bui TT, Le DH, Bui HTV, Nguyen HQ, Ngo BX, Tran VT (2018). A highly efficient Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation system for the postharvest pathogen Penicillium digitatum using DsRed and GFP to visualize citrus host colonization. Journal of Microbiological Methods 144:134-144.
    14. Nguyen KT, Ho QN, Do LTBX, Mai LTD, Pham DN, Tran HTT, Le DH, Nguyen HQ, Tran VT (2017). A new and efficient approach for construction of uridine/uracil auxotrophic mutants in the filamentous fungus Aspergillus oryzae using Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation. World Journal of Microbiology and Biotechnology 33(6):107.
    15. Nguyen KT, Ho QN, Pham TH, Phan TN, Tran VT (2016). The construction and use of versatile binary vectors carrying pyrG auxotrophic marker and fluorescent reporter genes for Agrobacterium-mediated transformation of Aspergillus oryzae. World Journal of Microbiology and Biotechnology 32(12):204.

    Sở hữu trí tuệ:

    • Trần Văn Tuấn, Vũ Xuân Tạo (2023). Quy trình phục hồi khả năng hình thành quả thể ở nấm Cordyceps militaris dựa trên gen giới tính. Bằng độc quyền Giải pháp hữu ích số 3265.

    Giáo trình, sách chuyên khảo:

    • Van-Tuan Tran, Hanh-Dung Thai, Tao Xuan Vu (2022). Chapter 9. Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation systems for genetic manipulation in agriculturally important fungi. In: Peter Jeschke, Evgeni B. Starikov: Agricultural Biocatalysis: Biological and Chemical Applications. Jenny Stanford Publishing /Taylor & Francis Group. https://doi.org/10.1201/9781003313144-13.

    3. ẢNH HOẠT ĐỘNG CỦA PHÒNG THÍ NGHIỆM

    4. ẢNH TẬP THỂ TIÊU BIỂU

    5. DANH SÁCH NGHIÊN CỨU SINH, HỌC VIÊN CAO HỌC, SINH VIÊN